Cami, bu yüzden sık sık fanatik Yahudilerin baskınlarına uğruyor. Fakat 25 Şubat 1994 tarihindeki baskın bahsi geçen Yahudi fanatiklerin baskınlarından oldukça farklı. 25 Şubat 1994'te sabah namazını kılan Müslümanların üzerine ateş açan Baruch Goldstein adlı Yahudi fanatik, camini kaderini kökten değiştirdi. 29 Filistinlinin şehit olduğu 150'den fazla kişinin yaralandığı katliamdan sonra kapatılan cami yeniden açıldığında yarısından fazlası Yahudilere tahsis edilmiş şekilde ikiye bölündü. İsrail askerlerinin giriş çıkışları denetlediği cami, hâlâ Yahudi yerleşimcilerin baskınlarına sahne oluyor.