منذ قدوم إمارة أفغانستان الإسلامية، أولت وزارة التعليم العالي اهتمامًا خاصًا بالبحوث، حيث نظّمت العديد من المؤتمرات الوطنية والدولية، وقدّمت مقترحات للجهات القطاعية.